アミノ酸 ペプチド タンパク質 タンパク質の機能と変性 天然変性タンパク質 |
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天然のアミノ酸はL型 | D-アミノ酸 | アミノ酸の等電点(isoelectric point, pI) |
アミノ酸の立体化学 グリシンにはL,Dの区別はない。 |
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アミノ酸 | 酸 塩基 | pKa |
a-カルボキシル基 | 3.1 | |
Asp, Glu | 4.1 | |
His | 6.0 | |
a-アミノ基 | 8.0 | |
Cys | 8.3 | |
Tyr | 10.9 | |
Lys | 10.8 | |
Arg | 12.5 |
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種類 | 例 |
1) ホルモンペプチド | インシュリン,オキシトシン, アンジオテンシンU |
2) 抗生物質 (D-アミノ酸や特殊アミノ酸を含むものが多い) |
ペニシリン,グラミシジンS |
3) 酵素阻害ペプチド | ロイペプチン,ペプスタチン, 植物トリプシンインヒビター |
4) 神経伝達物質 | メチオニンエンケファリン, サブスタンス P |
5) 呈味ペプチド | アスパルテーム |
6) 毒ペプチド | AM-トキシン,アマニチン, コブラトキシン |
7) その他 | グルタチオン(細胞内還元剤) |
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タンパク質 | 等電点 |
血清α1-グロブリン ハプトグロブリン 血清アルブミン 血清γ1-Globulin フィブリノーゲン ヘモグロビン 血清γ2-グロブリン ペプシン 卵白アルブミン インシュリン ヒストン リボヌクレアーゼ シトクロームc リゾチーム |
2.0 4.1 4.7 5.8 5.8 7.2 7.4 1.0 4.6 5.4 7.5-11.0 9.6 9.8 11.1 |
a-helix | b-sheet |
卵白リゾチームの3次構造。 左は主鎖だけをリボンで表したもの。赤,a-helix,橙,b-sheet 右は全ての原子を空間充填モデルで表したもの。 |
ヘモグロビンの1つの サブユニットの3次構造 |
ヘモグロビンの4次構造 |
いくつかのドメインの例: | ||
免疫グロブリンドメイン 7本のb-sheetが樽状に配置 |
EGFドメイン 3つのS-S結合が 上下に並んでいる |
a/bバレルドメイン |
橙色は,シスチン残基の硫黄原子 |
蛇毒メタロプロテアーゼは複数のドメインから成る | メタロプロテアーゼドメインの構造 |
それぞれのドメインを色を変えて示す。 青,メタロプロテアーゼドメイン; 赤,ディスインテグリンドメイン; 緑,Cyrichドメイン; 紫,C型レクチンドメイン |
構造未知のタンパク質 ↓精製 純粋なタンパク質 ↓還元剤でSS結合を切り、化学修飾する ↓いくつかのタンパク分解酵素で分解する 多くのペプチド断片 ↓分離・精製する ↓各断片のアミノ酸配列を決める ↓各断片の並び方を推定する タンパク質の全1次構造 |
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エドマン分解 |
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分類 | 機能 | 例 |
1) 酵素 2) 酵素阻害剤 3) 情報タンパク質 4) ホルモン 5) 輸送タンパク質 6) 防御タンパク質 7) 運動タンパク質 8) 毒タンパク質 9) 貯蔵タンパク質 10)構造タンパク質 |
触媒作用 酵素作用を阻害 細胞内情報伝達 細胞間情報伝達 物質輸送 生体防御 細胞の運動性 細胞毒 貯蔵栄養 細胞や細胞間の構築 |
トリプシン、乳酸脱水素酵素 マクログロブリン、トリプシンインヒビター ホルモン受容体 インシュリン、成長ホルモン ヘモグロビン、リポタンパク質 免役グロブリン、フィブリノーゲン アクチン、ミオシン 蛇毒タンパク質、リシン グリシニン、カゼイン コラーゲン、膜タンパク質、ウィルス殻タンパク質 |
非アミノ酸成分 | 例 | |
核タンパク質 | 核酸 | ヒストン、プロタミン |
リポタンパク質 | 脂質 | 血清リポタンパク質 |
糖タンパク質 | 糖質 | グリコホリン、免役グロブリン |
色素タンパク質 | 色素(ヘムなど) | シトクローム、ヘモグロビン |
金属タンパク質 | 金属イオン | トランスフェリン、フェリチン,メタロプロテアーゼ |
弱く加熱 冷却 |
強く加熱 |
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生の(native)タンパク質 [活性100%] |
部分変性状態 [低活性] |
完全変性状態 [不活性] |
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[タンパク質の変性] |
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